lundi 30 novembre 2020

ETUDE RECHERCHE USA La découverte génétique pourrait permettre de mieux évaluer le risque de suicide au sein des familles

La découverte génétique pourrait permettre de mieux évaluer le risque de suicide au sein des familles
titre original Genetic Discovery Could Lead to Better Prediction of Suicide Risk Within Families
Media Contacts Doug Dollemore Senior Science Writer, University of Utah Health Email: doug.dollemore@hsc.utah.edu

25 nov. 2020 https://healthcare.utah.edu/*

Les chercheurs de l'Institut de santé mentale Huntsman de l'Université de l'Utah ont détecté plus de 20 gènes qui pourraient jouer un rôle dans la mort par suicide.

Toutes les 11 minutes, un Américain se suicide. Cela représente 132 personnes par jour, soit plus de 48 000 par an. Pour ceux qui restent, la question obsédante est de savoir pourquoi.

Un facteur émergent est l'histoire de la famille. L'exemple le plus célèbre est peut-être la famille d'Ernest Hemingway. En plus de son propre suicide en 1961, le père, la soeur, le frère et la nièce du romancier se sont suicidés - en tout, cinq décès par suicide en trois générations. Mais il existe aussi des milliers de familles dans le monde entier qui ont un passé similaire et qui obligent les chercheurs à étudier la génétique des actes suicidaires.

Dans une nouvelle analyse de ce risque, des chercheurs de l'Institut de santé mentale Huntsman de l'Université de l'Utah ont détecté plus de 20 gènes qui pourraient jouer un rôle dans ces décès. L'étude, qui est l'une des premières analyses complètes du décès par suicide à l'échelle du génome, a également mis en évidence d'importantes interconnexions génétiques avec des maladies psychiatriques et des comportements associés au suicide, notamment le trouble bipolaire, la schizophrénie et les troubles du spectre autistique.

    "Cette étude et d'autres qui suivront vont nous permettre de mieux comprendre la constellation des facteurs de risque associés au suicide et de contribuer à réduire la stigmatisation qui y est associée".

Les chercheurs affirment que l'étude établit que la mort par suicide est partiellement héréditaire et qu'elle suit dans les familles indépendamment des effets d'un environnement commun. L'identification de ces facteurs de risque génétiques, disent-ils, pourrait permettre de mieux évaluer qui pourrait être exposé au risque de suicide et d'élaborer de nouvelles stratégies pour empêcher le pire de se produire.

"Ce qui est important dans cette étude, c'est que, en utilisant l'ensemble du génome, nous avons créé un score de risque génétique de suicide qui prédit le statut de cas-témoins en laboratoire", explique Anna R. Docherty, Ph.D., auteur principal de l'étude, généticienne quantitative à l'Institut de santé mentale Huntsman et professeur adjoint de psychiatrie à l'Université de la santé. "Cela peut également nous aider à étudier comment la génétique et l'environnement interagissent pour augmenter le risque de suicide. Nous sommes loin d'utiliser un quelconque score de risque génétique dans la clinique, mais c'est la première étape pour quantifier le risque biologique de suicide chez un individu".

L'étude est publiée dans l' American Journal of Psychiatry.

Bien que le stress, la solitude, les difficultés financières, les traumatismes de l'enfance et d'autres problèmes environnementaux puissent contribuer à la mort par suicide, les scientifiques pensent depuis longtemps que d'autres facteurs doivent intervenir.

"Lorsque je dis aux gens que le risque de suicide est estimé entre 45 et 55 % d'origine génétique, ils ont l'air très surpris", déclare le docteur Douglas Gray, co-auteur de l'étude et professeur de pédopsychiatrie spécialisé dans la prévention du suicide. Ils disent : "Non, c'est dû à la perte d'un emploi, à un sentiment d'impuissance ou à une rupture amoureuse". Si la rupture romantique était la cause du suicide, nous serions tous morts".

Auparavant, l'équipe de l'université de l'Utah Health avait identifié quatre variantes de gènes susceptibles d'amplifier le risque de suicide, sur la base d'un examen approfondi de 43 familles à haut risque. Mais cette recherche, comme beaucoup d'autres études sur le suicide génétique, s'est concentrée sur des segments génétiques spécifiques du génome humain.

Pour obtenir une image plus complète des gènes potentiellement impliqués dans le suicide, Docherty et ses collègues ont utilisé la technologie informatique pour analyser des millions de variantes d'ADN dans 3 413 échantillons obtenus auprès du bureau du médecin légiste de l'Utah. Certains de ces sujets qui s'étaient suicidés avaient des antécédents familiaux de suicide, mais d'autres n'en avaient pas.

Il s'agit du plus grand échantillon de décès par suicide au monde, ce qui constitue une amélioration majeure par rapport aux études génétiques précédentes. Ces échantillons ont été comparés à l'ADN de plus de 14 000 personnes ayant des ascendances correspondantes en dehors de l'État et qui ne sont pas mortes par suicide. Ils ont également examiné les dossiers médicaux pour déterminer les conditions de santé mentale et physique.

En utilisant une procédure appelée genome-wide association study (GWAS) , les chercheurs ont examiné les variantes génétiques connues sous le nom de SNP (prononcer "snips"), qui sont essentiellement des morceaux du code génétique. Ces millions de SNPs les ont aidés à identifier 22 gènes potentiellement impliqués dans un risque accru de décès par suicide, situés sur quatre chromosomes. Mais en utilisant ces millions de SNP dans une même formule, ils ont également été en mesure d'évaluer et d'évaluer le statut de suicide à partir de deux ensembles de données distincts.

Ils ont ensuite noté les décès par suicide en fonction des risques génétiques liés à d'autres problèmes, afin de voir si les personnes décédées par suicide pouvaient avoir des risques liés à des affections non mentionnées dans leur dossier médical. Les personnes décédées par suicide présentaient des risques génétiques significativement élevés d'impulsivité, de schizophrénie et de dépression majeure - des facteurs de risque critiques pour les décès par suicide.

Toutefois, les chercheurs soulignent que la génétique n'est qu'un des nombreux facteurs qui peuvent contribuer à la mort par suicide.

"La mort par suicide nécessite généralement une cascade d'événements", explique M. Gray. "Cette cascade pourrait inclure une prédisposition génétique combinée à une maladie mentale non traitée ou insuffisamment traitée, à la toxicomanie, aux tensions de la vie quotidienne lorsque le cerveau ne fonctionne pas bien, à la disponibilité des armes à feu et à un dernier facteur de stress instigateur, comme une rupture romantique, qui conduit à une tragédie".

Parmi les limites de l'étude, il faut noter que la majorité des cas de suicide sont d'origine nord-européenne. Tous les individus ayant un échantillon d'ADN dans l'analyse n'avaient pas de données disponibles dans leur dossier médical pour clarifier la présence ou l'absence d'un diagnostic de santé mentale. Les données manquantes peuvent signifier l'absence de diagnostic en raison de soins en dehors de l'État, d'un manque d'assurance, de facteurs culturels ou d'une stigmatisation.

À l'avenir, les chercheurs prévoient de mener des études plus vastes et plus diversifiées sur les décès par suicide, qui incluront des personnes d'origine mexicaine et amérindienne.

"Cette étude et d'autres qui suivront vont nous permettre de mieux comprendre la constellation des facteurs de risque associés au suicide et de contribuer à réduire la stigmatisation qui y est associée", déclare M. Docherty. "Nous espérons qu'elle encouragera les familles ayant des antécédents de suicide à en apprendre davantage et à discuter des facteurs de risque et de protection, comme elles le feraient pour d'autres affections médicales telles que l'hypertension ou les maladies cardiovasculaires".


https://healthcare.utah.edu/publicaffairs/news/2020/11/11-suicide-genetics.php

 

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 Etude Citée : Genome-Wide Association Study of Suicide Death and Polygenic Prediction of Clinical Antecedents
Anna R. Docherty
, Ph.D., Andrey A. Shabalin, Ph.D., Emily DiBlasi , Ph.D., Eric Monson, M.D.,Niamh Mullins , Ph.D.,Daniel E. Adkins, Ph.D., Silviu-Alin Bacanu , Ph.D.,Amanda V. Bakian, Ph.D.,Sheila Crowell, Ph.D., Danli Chen, Ph.D.,Todd M. Darlington, Ph.D.,William B. Callor, M.S., Erik D. Christensen, M.D., Douglas Gray, M.D.,Brooks Keeshin, M.D.,Michael Klein, M.S.,John S. Anderson, B.S.,Leslie Jerominski , M.S.,Caroline Hayward, Ph.D.,David J. Porteous, Ph.D.,Andrew McIntosh, M.D.,Qingqin Li, Ph.D.,Hilary Coon, Ph.D.


Abstract

Objective:

Death by suicide is a highly preventable yet growing worldwide health crisis. To date, there has been a lack of adequately powered genomic studies of suicide, with no sizable suicide death cohorts available for analysis. To address this limitation, the authors conducted the first comprehensive genomic analysis of suicide death using previously unpublished genotype data from a large population-ascertained cohort.
Methods:

The analysis sample comprised 3,413 population-ascertained case subjects of European ancestry and 14,810 ancestrally matched control subjects. Analytical methods included principal component analysis for ancestral matching and adjusting for population stratification, linear mixed model genome-wide association testing (conditional on genetic-relatedness matrix), gene and gene set-enrichment testing, and polygenic score analyses, as well as single-nucleotide polymorphism (SNP) heritability and genetic correlation estimation using linkage disequilibrium score regression.
Results:

Genome-wide association analysis identified two genome-wide significant loci (involving six SNPs: rs34399104, rs35518298, rs34053895, rs66828456, rs35502061, and rs35256367). Gene-based analyses implicated 22 genes on chromosomes 13, 15, 16, 17, and 19 (q<0.05). Suicide death heritability was estimated at an h2SNP value of 0.25 (SE=0.04) and a value of 0.16 (SE=0.02) when converted to a liability scale. Notably, suicide polygenic scores were significantly predictive across training and test sets. Polygenic scores for several other psychiatric disorders and psychological traits were also predictive, particularly scores for behavioral disinhibition and major depressive disorder.
Conclusions:

Multiple genome-wide significant loci and genes were identified and polygenic score prediction of suicide death case-control status was demonstrated, adjusting for ancestry, in independent training and test sets. Additionally, the suicide death sample was found to have increased genetic risk for behavioral disinhibition, major depressive disorder, depressive symptoms, autism spectrum disorder, psychosis, and alcohol use disorder compared with the control sample.
https://ajp.psychiatryonline.org/doi/10.1176/appi.ajp.2020.19101025